Kerstin Bögner studierte Blockflöte sowie Ensembleleitung (Chor-und Orchesterdirigieren) an der Staatlichen Hochschule für Musik Stuttgart u.a. bei Prof. Dieter Kurz. 
Im Rahmen des Aufbaustudiums Blockflöte bei Baldrick Deerenberg am Konservatorium Utrecht/Niederlande absolvierte sie das Solistenexamen im Juni 1998 mit Auszeichnung. Ab Oktober 1998 studierte Kerstin Bögner Orchesterleitung in der Klasse von Prof. Dr. Peter Gülke an der Musikhochschule Freiburg und schloss diesen Aufbaustudiengang im 
Juni 2000 mit Auszeichnung ab. Meisterkurse bei George Hurst in Großbritannien ergänzten ihre Ausbildung. Kerstin Bögner studiert Gesang bei Heidemarie Tiemann in Freiburg.
Die Leitung des Kammerchors Staufen hat sie 1999 übernommen. 
Gegenwärtig arbeitet sie außerdem mit dem Kirchenchor 
St. Martin Staufen, mit dem Spatzen- und Nachtigallenchor der Jugendmusikschule Südlicher Breisgau e.V. in Kooperation mit der Thaddäus-Rinderle-Schule und mit Früherziehungsgruppen der Jugendmusikschule in Staufen und Münstertal.